跑完步腰兩側疼可能是肌肉疲勞、腰部扭傷、腰椎間盤突出、腎結石、泌尿系統感染等因素，需要針對病因治療，可採取的方法有休息、物理治療、藥物治療、手術治療等。
1.肌肉疲勞：長時間跑步可能導致腰部肌肉疲勞，產生疼痛。這種情況下，應適當休息，避免過度勞累，可對腰部進行熱敷、按摩，以緩解疼痛。遵醫囑用藥，如布洛芬緩釋膠囊、雙氯芬酸鈉腸溶片、氯唑沙宗片。
2.腰部扭傷：跑步時姿勢不正確或用力過猛可能導致腰部扭傷。扭傷後應立即停止運動，臥床休息，受傷24小時內冷敷，24小時後熱敷。遵醫囑用藥，如跌打丸、活血止痛膠囊、傷科跌打片。
3.腰椎間盤突出：本身患有腰椎間盤突出的人，跑步可能會加重病情，導致腰兩側疼。需要臥床休息，可進行牽引、理療等治療。遵醫囑用藥，如甲鈷胺片、腰痛寧膠囊、根痛平顆粒。
4.腎結石：腎結石在跑步時可能會移動，刺激腎臟或輸尿管，引起腰兩側疼痛。建議多喝水，促進結石排出。如果疼痛嚴重，應及時就醫，根據結石的大小和位置，選擇合適的治療方法。遵醫囑用藥，如腎石通顆粒、排石顆粒、枸櫞酸氫鉀鈉顆粒。
5.泌尿系統感染：泌尿系統感染也可能導致腰兩側疼，同時還可能伴有尿頻、尿急、尿痛等症狀。需要多喝水，注意個人衛生。遵醫囑用藥，如左氧氟沙星片、三金片、呋喃妥因腸溶片。
如果跑完步後腰兩側疼的症狀持續不緩解或加重，應及時就醫，明確病因，進行針對性治療。在日常生活中，跑步前應做好熱身運動，掌握正確的跑步姿勢，避免過度運動。
