腰痛上小便痛可能是泌尿系統感染、泌尿系統結石、前列腺炎、腰椎間盤突出症、外傷等因素，需要針對病因治療，可採取的方法有藥物治療、手術治療、物理治療等。
1. 泌尿系統感染：多由細菌感染引起，如大腸埃希菌。表現為尿頻、尿急、尿痛，伴有腰痛。治療可使用抗生素，如左氧氟沙星片、頭孢呋辛酯膠囊、三金片等，同時要多喝水，注意個人衛生。
2. 泌尿系統結石：結石在泌尿系統內移動時，可引起疼痛，疼痛可放射至腰部，同時伴有血尿、尿痛。較小的結石可通過多飲水、多運動排出，較大的結石可能需要體外衝擊波碎石或手術治療。藥物治療可選擇排石顆粒、腎石通顆粒、枸櫞酸氫鉀鈉顆粒等。
3. 前列腺炎：可出現會陰部疼痛、尿頻、尿痛，有時疼痛可放射至腰部。治療可採用抗生素如阿奇霉素分散片、鹽酸多西環素片、羅紅霉素膠囊、α受體阻滯劑如鹽酸坦索羅辛緩釋膠囊等藥物，同時可配合溫水坐浴等物理治療。
4. 腰椎間盤突出症：突出的椎間盤壓迫神經，可引起腰痛，有時可伴有下肢放射性疼痛、麻木，當壓迫馬尾神經時，可出現大小便功能障礙。治療方法包括臥床休息、牽引、理療、按摩等，藥物可選擇布洛芬緩釋膠囊、甲鈷胺片、腰痛寧膠囊等，保守治療無效時可能需要手術治療。
5. 外傷：腰部或泌尿系統受到外傷，可導致腰痛和小便痛。需要根據損傷的程度進行治療，如休息、冷敷、包扎等，如有骨折或嚴重損傷，可能需要手術治療。藥物可選用跌打丸、活血止痛膠囊、雲南白藥膠囊等。
在日常生活中，要注意保持良好的生活習慣，避免過度勞累，多喝水，勤排尿，注意個人衛生。如果出現腰痛上小便痛的症狀，應及時就醫，明確診斷後進行針對性治療。
