吃藥後出現肚子疼、頭疼可能是藥物的不良反應引起，也可能是原有疾病的症狀，還可能與個體的過敏反應、藥物相互作用以及用藥不當等有關。常見的原因如下：
1. 藥物不良反應：部分藥物可能會對胃腸道產生刺激，導致肚子疼；同時，一些藥物可能影響神經系統，引起頭疼。如非甾體抗炎藥等。應及時停藥，咨詢醫生是否需要更換藥物。
2. 原有疾病症狀：如果本身患有胃腸道疾病或神經系統疾病，吃藥後可能仍會出現肚子疼、頭疼的症狀。需要積極治療原發疾病。
3. 過敏反應：對某些藥物成分過敏，可能會出現肚子疼、頭疼，還可能伴有皮疹、瘙癢等症狀。需立即停藥，並進行抗過敏治療。
4. 藥物相互作用：同時服用多種藥物時，藥物之間可能發生相互作用，導致不良反應。應告知醫生正在服用的所有藥物，以便調整用藥方案。
5. 用藥不當：未按照醫囑的劑量、時間或方法服藥，可能引起不適。需嚴格按照醫囑用藥。
在日常生活中，用藥時要仔細閱讀藥品說明書，瞭解藥物的適應證、禁忌證和不良反應等。如果出現不適症狀，應及時就醫，以便得到及時的診斷和治療。
