假膜性腸炎的治療方法主要有停用相關抗生素、藥物治療、調節腸道菌群、支持治療、手術治療等。
1. 停用相關抗生素：假膜性腸炎多由使用抗生素後腸道菌群失調，艱難梭菌大量繁殖所致。停用誘發疾病的相關抗生素，可減少對腸道正常菌群的進一步破壞，消除艱難梭菌過度生長的誘發因素，為腸道菌群恢復創造條件，有助於減輕假膜性腸炎症狀，促進病情好轉。停用可能導致假膜性腸炎的抗生素，如林可霉素、克林霉素等，避免繼續使用加重腸道菌群紊亂。
2. 藥物治療：針對假膜性腸炎，常用的藥物有甲硝唑片、萬古霉素膠囊、 fidaxomicin 片等。甲硝唑片能抑制厭氧菌生長，對艱難梭菌有較好的抗菌活性，可口服，一般每日 3 - 4 次，通過干擾細菌代謝發揮殺菌作用。萬古霉素膠囊口服後在腸道內保持高濃度，不易被吸收，能有效抑制艱難梭菌，通常按一定劑量分 4 次服用，可阻止細菌細胞壁合成達到治療目的。fidaxomicin 片對艱難梭菌有高度選擇性，能抑制細菌 RNA 合成，遵醫囑服用可有效治療假膜性腸炎。
3. 調節腸道菌群：假膜性腸炎破壞了腸道正常菌群平衡。補充益生菌如雙歧桿菌四聯活菌片、地衣芽孢桿菌活菌膠囊等，可調節腸道微生態。雙歧桿菌四聯活菌片含有多種有益菌，能在腸道內定植，抑制有害菌生長，改善腸道功能。地衣芽孢桿菌活菌膠囊能產生多種抗菌物質，調節腸道菌群，增強腸道屏障功能，有助於恢復腸道正常的生態環境，緩解假膜性腸炎症狀。
4. 支持治療：假膜性腸炎患者常因腹瀉等導致水電解質紊亂、營養不良等。通過靜脈輸注葡萄糖、生理鹽水、電解質溶液等，維持水、電解質平衡，保證身體正常代謝需求。對於營養狀況差的患者，可給予腸內或腸外營養支持，補充蛋白質、維生素等營養物質，增強患者抵抗力，利於身體恢復，提高對疾病的耐受和恢復能力。
5. 手術治療：少數嚴重的假膜性腸炎患者，如出現腸梗阻、腸穿孔等嚴重併發症時需手術治療。手術方式包括病變腸段切除、腸造口術等。切除病變腸段可直接去除感染病灶，防止病情進一步惡化。腸造口術能暫時解除腸道梗阻，改善患者症狀，輓救生命。但手術風險較高，需嚴格評估患者身體狀況和病情後謹慎選擇。
治療期間要密切關注病情變化，如腹瀉次數、糞便性狀、體溫等。按照醫生要求按時服藥，不可自行增減藥量或停藥。注意飲食調整，選擇易消化、富含營養的食物，避免食用刺激性食物，以減輕腸道負擔，促進身體恢復。
