霉菌性食管炎的治療方法主要有藥物治療、飲食調整、改善生活習慣、去除誘因、手術治療等。
1. 藥物治療：霉菌性食管炎主要由霉菌感染引發，藥物治療是關鍵。常用藥物有制霉菌素片，它能與真菌細胞膜上的甾醇相結合，改變細胞膜的通透性，使菌體內的重要物質外漏，從而抑制霉菌生長。氟康唑膠囊可抑制真菌細胞膜麥角甾醇的生物合成，影響細胞膜的通透性，達到抗菌效果。伊曲康唑口服液能高度選擇性地抑制真菌細胞的細胞色素P450的活性，從而阻礙真菌細胞膜麥角甾醇的合成，最終使真菌死亡，遵醫囑使用這些藥物可有效對抗霉菌感染。
2. 飲食調整：霉菌性食管炎患者的飲食調整很重要。應避免食用辛辣、刺激性食物，如辣椒、芥末等，這類食物會刺激食管黏膜，加重炎症。過冷、過熱的食物也不宜食用，以免影響食管黏膜的修復。多吃富含維生素和蛋白質的食物，像新鮮的蔬菜、水果、牛奶、雞蛋等，能增強身體抵抗力，有助於食管黏膜的恢復，對霉菌性食管炎的康復有益。
3. 改善生活習慣：良好的生活習慣有助於霉菌性食管炎恢復。規律作息，保證充足睡眠，可使身體各器官得到充分休息，利於免疫系統正常運轉，增強對霉菌的抵抗力。避免熬夜，熬夜會導致身體免疫力下降，使霉菌更容易滋生和繁殖。適當運動，如散步、慢跑等，能促進血液循環，增強體質，提高身體的抗病能力，對控制霉菌性食管炎病情有積極作用。
4. 去除誘因：很多因素會誘發霉菌性食管炎，去除誘因能防止病情反復。長期使用抗生素、糖皮質激素等藥物可能破壞體內菌群平衡，導致霉菌大量繁殖。若因病情需要使用這些藥物，應在醫生指導下合理調整用藥。患有糖尿病等基礎疾病的患者，血糖控制不佳易滋生霉菌，所以要積極控制血糖，保持血糖穩定，減少霉菌感染的機會。
5. 手術治療：一般霉菌性食管炎通過保守治療可控制病情，但在少數嚴重情況下需手術治療。比如食管黏膜出現嚴重潰瘍、狹窄，影響正常吞咽功能，保守治療效果不佳時，可能需要手術干預。手術方式包括食管擴張術，通過擴張食管狹窄部位，改善吞咽困難症狀；食管部分切除術，切除病變嚴重的食管組織，防止病情進一步惡化，不過手術風險較大，需謹慎評估後進行 。
治療期間要嚴格按照醫生要求用藥，不可自行增減藥量或停藥。注意飲食衛生，避免再次感染霉菌。保持良好心態，情緒過度緊張焦慮可能影響身體恢復。定期復查，以便醫生及時瞭解病情變化，調整治療方案。
