包皮水皰可能是摩擦刺激、局部感染、過敏反應、性傳播疾病、自身免疫性疾病等因素導致，需要針對病因治療，可採取的方法有減少摩擦、抗感染、抗過敏、針對性病治療、調節免疫等。
1. 摩擦刺激：性生活過於劇烈、手淫時用力不當等，都可能導致包皮局部受到摩擦，引起組織液滲出形成水皰。應避免再次受到摩擦刺激，近期減少性生活頻率，避免手淫。保持局部清潔，可用溫水清洗，待水皰自行吸收。若水皰較大，可在醫生操作下用無菌注射器抽取皰液，之後塗抹紅霉素軟膏、莫匹羅星軟膏、夫西地酸乳膏，需遵醫囑用藥。
2. 局部感染：細菌、真菌等病原體感染包皮，引發炎症，炎症刺激可出現水皰。細菌感染可遵醫囑口服頭孢克肟膠囊、阿莫西林膠囊、左氧氟沙星片，同時用碘伏消毒後塗抹百多邦軟膏；真菌感染可外用克霉唑乳膏、酮康唑乳膏、硝酸咪康唑乳膏，嚴重時可口服伊曲康唑膠囊，均需遵醫囑。
3. 過敏反應：使用了不合適的避孕套、清潔劑等，接觸過敏原後，包皮可出現過敏反應，表現為水皰。首先要遠離過敏原，用清水沖洗。可口服氯雷他定片、西替利嗪片、依巴斯汀片，外用爐甘石洗劑、地奈德乳膏、糠酸莫米松乳膏，遵醫囑用藥。
4. 性傳播疾病：如生殖器皰疹，由單純皰疹病毒感染引起。可遵醫囑口服阿昔洛韋片、伐昔洛韋片、泛昔洛韋片，外用噴昔洛韋乳膏、重組人干擾素α2b凝膠、膦甲酸鈉乳膏。治療期間避免性行為，性伴侶需同時檢查治療。
5. 自身免疫性疾病：如天皰瘡等累及包皮部位，可出現水皰。需就醫評估病情，一般可使用糖皮質激素如潑尼松片、甲潑尼龍片，免疫抑制劑如環磷酰胺片、硫唑嘌呤片等治療，具體用藥及劑量嚴格遵醫囑。
治療期間要保持包皮局部清潔乾燥，避免搔抓，防止水皰破裂繼發感染。飲食上避免食用辛辣刺激性食物，戒煙戒酒。按照醫生要求定期復診，以便及時調整治療方案。
