HPV疫苗二價、四價、九價的主要區別體現在覆蓋的HPV亞型數量、預防疾病範圍及適用人群等方面，具體如下：
1. 覆蓋的HPV亞型不同
二價疫苗針對高危型HPV16和18型，這兩種病毒與約70%的宮頸癌相關。四價疫苗在二價基礎上增加了低危型HPV6和11型，可預防生殖器疣等良性病變。九價疫苗則覆蓋了HPV6、11、16、18、31、33、45、52、58九種亞型，其中新增的31、33、45、52、58型屬於高危型，與90%的宮頸癌相關。
2. 預防疾病範圍不同
二價疫苗主要預防宮頸癌；四價疫苗在預防宮頸癌的同時，可降低生殖器疣風險；九價疫苗覆蓋範圍最廣，除宮頸癌、生殖器疣外，還能預防陰道癌、外陰癌及肛門癌等。
3. 適用年齡與接種程序
目前國內三類疫苗均適用於9-45歲女性。接種程序方面，二價為0、1、6個月，四價和九價為0、2、6個月。九價疫苗雖覆蓋更廣，但需注意其擴齡後仍需遵循間隔接種時間。
4. 價格差異
九價疫苗因研發成本高，價格通常高於四價和二價。但研究顯示，二價疫苗對HPV16/18型保護效果顯著，性價比高。
女性可根據年齡、經濟條件及可及性選擇疫苗，無需盲目追求高價數。9-14歲為最佳接種年齡，盡早接種可獲更全面保護。接種後仍需定期進行宮頸癌篩查，以降低感染風險。
