新生兒咳嗽喉嚨有痰可能是吞咽功能不完善、環境因素、呼吸道感染、過敏、先天性喉軟骨軟化等因素導致，需要針對病因治療，可採取的方法有調整餵養、改善環境、藥物治療等。
1. 吞咽功能不完善：新生兒吞咽功能尚未發育成熟，口腔分泌物不能及時吞咽，就會積聚在喉嚨產生痰鳴音。通常隨著年齡增長會逐漸改善，平時餵奶後適當竪抱、輕拍背部，促進空氣排出，減少反流。
2. 環境因素：室內空氣乾燥、寒冷或有刺激性氣味等，都可能刺激新生兒呼吸道，導致咳嗽有痰。要保持室內空氣流通，溫度控制在 22 - 24℃，濕度在 50% - 60%。可使用加濕器增加空氣濕度，避免在室內吸煙。
3. 呼吸道感染：病毒、細菌等感染引起呼吸道炎症，導致分泌物增多。如果是病毒感染，一般可自愈，注意護理；細菌感染需遵醫囑使用抗生素，如阿莫西林顆粒、頭孢克肟顆粒、阿奇霉素乾混懸劑。同時可配合氨溴索口服液稀釋痰液，促進排出。
4. 過敏：接觸塵蟎、花粉等過敏原，引發呼吸道過敏反應。要盡量避免接觸已知過敏原，保持居住環境清潔。症狀嚴重時，遵醫囑使用氯雷他定糖漿、西替利嗪滴劑、孟魯司特鈉咀嚼片緩解症狀。
5. 先天性喉軟骨軟化：胎兒期缺鈣，導致喉軟骨發育不良。一般在 2 歲左右可自行緩解，平時要保證充足奶量攝入，適當補充維生素 D 滴劑、碳酸鈣顆粒、葡萄糖酸鈣口服液，多曬太陽促進鈣吸收。
日常要密切觀察新生兒的精神狀態、呼吸情況、體溫等。餵奶時注意姿勢，避免嗆奶。若症狀持續不緩解或加重，如出現呼吸急促、發熱等，應及時就醫。
