不存在治療膀胱囊腫最好的方法，因為治療方式需依據囊腫大小、位置、患者症狀及身體狀況等多方面因素綜合考量。
對於較小且無症狀的膀胱囊腫，通常採取定期觀察的策略。通過定期的超聲、CT等檢查，密切監測囊腫的大小、形態變化。這是由於這類囊腫可能長期保持穩定，不影響患者的正常生活與健康，無需過度干預。
當囊腫較大，產生壓迫症狀，如導致排尿困難、血尿等，或者囊腫存在惡變傾向時，手術治療往往是主要選擇。手術方式有多種，經尿道膀胱囊腫切除術是較為常用的一種。該手術通過尿道插入特殊器械，在直視下將囊腫切除，具有創傷小、恢復快的優點。若囊腫位置特殊或與周圍組織粘連嚴重，可能需要進行開放性手術，直接切除囊腫。
對於一些不適宜手術或拒絕手術的患者，也可考慮保守治療。比如通過藥物緩解相關症狀，控制可能出現的感染等併發症。
在治療後，患者要保持良好的生活習慣。日常需多喝水，增加排尿量，有助於沖洗尿道，減少細菌滋生和感染風險。同時，要注意休息，避免劇烈運動和重體力勞動，讓身體有足夠時間恢復。飲食上，盡量避免食用辛辣、刺激性食物，以清淡、營養均衡的飲食為主。按照醫生要求定期復查，以便及時發現問題並採取相應措施。
