橋本甲狀腺炎需要與單純性甲狀腺腫、亞急性甲狀腺炎、Graves病、甲狀腺癌、萎縮性甲狀腺炎等疾病進行鑒別。
1. 單純性甲狀腺腫：甲狀腺呈瀰漫性或結節性腫大，一般無疼痛，甲狀腺功能多正常，甲狀腺自身抗體一般陰性，缺碘、致甲狀腺腫物質等環境因素常為誘因。
2. 亞急性甲狀腺炎：起病較急，常有上呼吸道感染前驅症狀，甲狀腺有明顯疼痛、壓痛，可伴有發熱等全身症狀，甲狀腺攝碘率明顯降低，血沈增快，甲狀腺自身抗體滴度一般不高。
3. Graves病：有高代謝症狀如多汗、心慌、手抖、多食易飢等，甲狀腺瀰漫性腫大，可聞及血管雜音，突眼等眼徵常見，甲狀腺激素水平升高，促甲狀腺素受體抗體TRAb等自身抗體陽性。
4. 甲狀腺癌：甲狀腺結節質地硬、固定，邊界不清，可伴有頸部淋巴結腫大，超聲等影像學檢查可發現結節形態不規則、有鈣化等特徵，細針穿刺細胞學檢查有助於診斷。
5. 萎縮性甲狀腺炎：甲狀腺萎縮變小，甲狀腺功能減退表現明顯，甲狀腺自身抗體陽性，與橋本甲狀腺炎晚期甲狀腺萎縮階段有相似之處，但萎縮性甲狀腺炎起病時甲狀腺即萎縮。
對於疑似橋本甲狀腺炎的患者，應及時就醫，進行全面的檢查評估，包括甲狀腺功能、自身抗體、超聲等，以便明確診斷，制定合理的治療方案，定期復查甲狀腺相關指標，根據病情變化調整治療。
