青霉菌性角膜炎可以用抗真菌藥物、促進角膜修復藥物、散瞳藥物、免疫調節劑等方法治療。
1. 抗真菌藥物：對於青霉菌性角膜炎，抗真菌藥物能抑制或殺滅真菌，從而控制感染。常見的有那他霉素滴眼液，它能與真菌細胞膜上的麥角固醇結合，改變細胞膜的通透性，使真菌細胞內的物質外漏，達到殺菌作用；氟康唑滴眼液，通過抑制真菌細胞色素P450依賴酶，干擾真菌細胞膜麥角固醇的生物合成而起效；兩性霉素B眼膏，可與真菌細胞膜上的甾醇結合，損傷膜的通透性，導致細胞內重要物質外漏而使真菌死亡，遵醫囑使用。
2. 促進角膜修復藥物：此類藥物能加速角膜組織的修復，減輕炎症對角膜的損傷。小牛血去蛋白提取物眼用凝膠，含有多種氨基酸、低分子肽和碳水化合物，能促進細胞對葡萄糖和氧的攝取與利用，增加細胞能量代謝，從而促進角膜修復；重組人表皮生長因子滴眼液，可促進角膜上皮細胞的增殖、分化和遷移，加速角膜創面愈合，按要求使用。
3. 散瞳藥物：散瞳藥物可防止虹膜後粘連，減輕眼部疼痛等症狀。阿托品眼膏，能使瞳孔括約肌和睫狀肌鬆弛，解除睫狀肌痙攣，減少炎症刺激，同時可防止虹膜與晶狀體粘連，避免併發症的發生；復方托吡卡胺滴眼液，能快速散瞳和調節麻痹，利於眼部檢查和緩解眼部不適，遵醫囑應用。
4. 免疫調節劑：免疫調節劑可調節機體的免疫功能，輔助治療青霉菌性角膜炎。左旋咪唑片，可增強機體的細胞免疫功能，提高機體抵抗力，有助於抗真菌；轉移因子膠囊，能將供體的細胞免疫信息轉移給受體，增強受體的免疫功能，輔助控制炎症，按規定服用。
治療期間要嚴格按照醫生的囑咐用藥，按時復診。注意保持眼部清潔，避免揉眼，防止眼部再次感染。同時，要注意休息，避免用眼過度，飲食上多攝入富含營養的食物，促進病情恢復。
