一般情況下，微波爐不能殺死乙肝病毒。
乙肝病毒是一種較為頑強的病毒，它對熱、乾燥、紫外線及一般濃度的消毒劑等都有一定的耐受性。微波爐主要是通過微波使物體內的極性分子如水分子等快速振動、摩擦產生熱量來加熱物體，其加熱方式主要是使物體整體升溫，而不是針對病毒等微生物進行直接的殺滅作用。
一般情況下，乙肝病毒在體外環境中能存活一定時間，如在血液中可存活數天至數周，在乾燥環境中能存活數小時。雖然高溫可以使乙肝病毒失活，比如在 100℃的沸水中持續幾分鐘可以使其失去活性，但微波爐的加熱方式和溫度通常達不到這樣的效果，難以徹底殺死乙肝病毒。
使用微波爐加熱食物時，應確保食物完全熟透，以避免因加熱不均勻而導致部分食物未達到殺菌溫度。同時，對於可能被乙肝病毒污染的物品，不能單純依靠微波爐來消毒，還需結合其他有效的消毒方法，如使用含氯消毒劑等。並且，在處理乙肝患者的物品或接觸乙肝病毒時，應採取嚴格的防護措施，避免病毒傳播。
