一般來說，咳嗽吃頭孢還是阿莫西林不能簡單地一概而論，這取決於咳嗽的病因等因素。
原理方面，頭孢菌素類和青霉素類藥物都屬於抗生素，主要用於治療由細菌感染引起的疾病。頭孢菌素類抗生素的抗菌譜較廣，對多種革蘭氏陽性菌和革蘭氏陰性菌有較強的殺菌作用；青霉素類抗生素則對革蘭氏陽性菌的作用較強，對某些革蘭氏陰性菌也有一定的抗菌活性。
如果咳嗽是由肺炎鏈球菌、溶血性鏈球菌等革蘭氏陽性菌感染引起的，通常使用阿莫西林較為合適，因為阿莫西林屬於青霉素類抗生素，對這類細菌有較好的抗菌效果。但如果是由流感嗜血桿菌、大腸埃希菌等革蘭氏陰性菌感染，或者是由耐藥菌引起的感染，頭孢類抗生素可能更適合，因為頭孢菌素類抗生素對這些細菌的抗菌活性可能更強。
很多咳嗽並非由細菌感染引起，而是由病毒感染、過敏、氣道刺激等因素導致。對於這些原因引起的咳嗽，使用抗生素是無效的，不僅不能緩解咳嗽症狀，還可能導致抗生素濫用，增加耐藥菌的產生。
注意事項：如果咳嗽持續不緩解或伴有發熱、咳痰、呼吸困難等症狀，應及時就醫，明確咳嗽的病因，在醫生的指導下選擇合適的治療藥物，不要自行隨意使用抗生素。只有明確是細菌感染引起的咳嗽，並且根據藥敏試驗等結果選擇合適的抗生素，才能達到較好的治療效果。
