輸尿管口異位可能是先天性發育異常、輸尿管囊腫、輸尿管結石、泌尿系統感染、輸尿管損傷等因素，需要針對病因治療，可採取的方法有手術治療、藥物治療、物理治療等。
1. 先天性發育異常：在胚胎發育過程中，輸尿管芽與後腎胚基的連接出現異常，導致輸尿管開口位置異常。對於症狀較輕、腎功能影響小的患者，可先密切觀察。若症狀明顯、影響腎功能，多需手術治療，如輸尿管膀胱再植術等，重建輸尿管與膀胱的正常連接結構，恢復正常排尿生理。
2. 輸尿管囊腫：輸尿管末端在膀胱內形成囊腫，可壓迫輸尿管口，使其位置改變。較小囊腫且無症狀者，定期復查觀察變化。囊腫較大或引起梗阻等症狀時，可經尿道囊腫電切術等手術處理。術後注意預防感染，必要時遵醫囑使用頭孢克肟膠囊、阿莫西林克拉維酸鉀片、左氧氟沙星片抗感染。
3. 輸尿管結石：結石在輸尿管內移動，刺激輸尿管，可能導致輸尿管口位置改變。較小結石可通過多飲水、多運動促進排出，也可配合排石顆粒、腎石通顆粒、金錢草顆粒等藥物輔助排石，需遵醫囑用藥。結石較大無法自行排出時，可採取體外衝擊波碎石、輸尿管鏡取石等治療。
4. 泌尿系統感染：細菌等病原體感染泌尿系統，炎症刺激可使輸尿管口黏膜充血、水腫，影響其正常位置。根據病原體類型選擇藥物，如細菌性感染常用頭孢呋辛酯片、阿奇霉素膠囊、甲硝唑片，遵醫囑足量足療程用藥。同時要增加水分攝入，促進尿液排出，衝刷尿道。
5. 輸尿管損傷：外傷、醫源性操作等導致輸尿管損傷，愈合過程中可能引起輸尿管口異位。輕度損傷可保守治療，使用止血藥物如氨甲環酸片、抗感染藥物如頭孢拉定膠囊、促進組織修復藥物如康復新液等，遵醫囑使用。嚴重損傷多需手術修復。
治療後要保持規律作息，避免劇烈運動和重體力勞動。飲食上，減少辛辣、刺激性食物攝入，增加水分攝入，保證每日尿量充足。按照醫生要求定期復查，以便及時發現異常並處理。
