卡氏肺孢子蟲病可能是免疫功能低下、長期使用免疫抑制劑、營養不良、居住環境不佳、基礎疾病等因素，需要針對病因治療，可採取的方法有增強免疫力、調整藥物使用、改善營養、優化居住環境、治療基礎疾病等。
1. 免疫功能低下：一些人群因先天性免疫缺陷等生理原因導致免疫功能較差，容易受到卡氏肺孢子蟲的侵襲。可通過適當運動，如散步、太極拳等增強體質，合理作息保證充足睡眠。藥物方面，可遵醫囑使用轉移因子口服液、匹多莫德顆粒、脾氨肽口服凍乾粉，提升機體免疫力，降低感染風險。
2. 長期使用免疫抑制劑：因疾病治療需要長期服用免疫抑制劑，會抑制免疫系統，增加感染幾率。應與醫生溝通，評估病情後看是否能調整藥物劑量或更換藥物。若病情允許，逐漸減少免疫抑制劑用量。可遵醫囑選用甲氨蝶呤片、環孢素軟膠囊、他克莫司膠囊，使用過程中嚴格按要求監測各項指標。
3. 營養不良：身體缺乏必要營養物質，會使抵抗力下降，利於病原體入侵。要調整飲食結構，保證攝入足夠蛋白質、維生素等營養成分，多吃雞蛋、新鮮蔬果等。也可遵醫囑服用多維元素片、復方氨基酸膠囊、脂肪乳注射液，改善營養狀況。
4. 居住環境不佳：生活在潮濕、衛生條件差的環境，易滋生卡氏肺孢子蟲。需保持居住環境乾燥、清潔，定期開窗通風，勤打掃房間。必要時可使用空氣淨化器、除濕器等設備改善環境。
5. 基礎疾病：如慢性阻塞性肺疾病等病理因素會影響肺部功能，增加感染風險。積極治療基礎疾病，如慢性阻塞性肺疾病患者可遵醫囑使用沙丁胺醇氣霧劑、布地奈德福莫特羅粉吸入劑、噻托溴銨粉霧劑，控制病情發展，降低卡氏肺孢子蟲病發生幾率。
治療期間要嚴格按醫生要求用藥，不可自行增減劑量或停藥。定期到醫院復查，以便及時瞭解病情變化和治療效果。保持良好心態，避免焦慮緊張，注意保暖，防止著涼引發呼吸道感染加重病情 。
