腎臟萎縮可能是腎動脈狹窄、長期腎積水、慢性腎盂腎炎、先天性腎發育不全、藥物性腎損傷等因素，需要針對病因治療，可採取的方法有手術、藥物治療等。
1. 腎動脈狹窄：腎動脈狹窄會導致腎臟血液供應不足，引起腎臟萎縮。多由動脈粥樣硬化、纖維肌性發育不良等導致。對於症狀較輕的，可遵醫囑使用硝苯地平緩釋片、馬來酸依那普利片、阿托伐他汀鈣片穩定病情。嚴重時需進行介入治療如腎動脈支架置入術或外科手術如腎動脈搭橋術等改善腎動脈供血。
2. 長期腎積水：泌尿系統梗阻致使尿液排出不暢，長期積聚壓迫腎實質，造成腎萎縮。常見梗阻原因有結石、前列腺增生等。若是結石引起，較小結石可遵醫囑用排石顆粒、金錢草顆粒，配合大量飲水和運動促進排出；較大結石可能需體外衝擊波碎石或手術取石。前列腺增生導致的，可遵醫囑口服非那雄胺片、鹽酸坦索羅辛緩釋膠囊、前列舒通膠囊，嚴重時手術切除增生組織。
3. 慢性腎盂腎炎：細菌感染腎盂引發慢性炎症，長期炎症刺激損傷腎組織，逐漸導致腎萎縮。多由上行感染、血行感染等引起。治療需遵醫囑使用抗生素，如左氧氟沙星膠囊、頭孢克肟分散片、阿莫西林克拉維酸鉀片，足療程治療控制感染，同時要多喝水、勤排尿，衝刷尿道減少細菌滋生。
4. 先天性腎發育不全：胚胎發育過程中腎臟發育異常，導致腎臟體積小於正常。這是一種先天性生理因素。一般無特效治療方法，主要是定期監測腎功能、血壓等指標，若出現腎功能異常或高血壓等情況，針對性治療，如出現高血壓，可遵醫囑用氨氯地平片、厄貝沙坦片、吲達帕胺片控制血壓。
5. 藥物性腎損傷：長期或不當使用某些藥物，如非甾體抗炎藥、氨基糖苷類抗生素等，損害腎小管間質，引起腎萎縮。首先要停用導致腎損傷的藥物。可遵醫囑使用百令膠囊、金水寶膠囊、海昆腎喜膠囊等保護腎臟，促進腎功能恢復，同時要密切監測腎功能變化。
日常要保持健康的生活方式，規律作息，避免勞累，飲食上控制鹽和蛋白質攝入，定期復查腎功能、腎臟超聲等指標，根據身體狀況和檢查結果調整治療方案。
