生殖器上有痘痘可能是局部摩擦、過敏、皮脂腺囊腫、尖銳濕疣、毛囊炎等因素，需要針對病因治療，可採取的方法有保持清潔、藥物治療、手術治療等。
1. 局部摩擦：緊身衣物、頻繁性生活等過度摩擦生殖器，可能導致局部出現痘痘樣改變。應選擇寬松、棉質的內褲和衣物，減少摩擦。避免性生活過於劇烈，保持生殖器局部清潔，用溫水清洗，避免使用刺激性強的清潔劑。一般經過一段時間的護理，痘痘可自行消退。
2. 過敏：接觸某些過敏原，如避孕套材質、新換的沐浴露等，可能引發過敏反應出現痘痘。需及時明確並遠離過敏原，症狀較輕時，可遵醫囑外用爐甘石洗劑、地奈德乳膏、丁酸氫化可的松乳膏。若症狀較重，可口服氯雷他定片、西替利嗪膠囊、依巴斯汀片等藥物治療。
3. 皮脂腺囊腫：因皮脂腺導管堵塞，皮脂腺分泌的皮脂無法正常排出而形成囊腫。較小的囊腫一般無需特殊處理，注意觀察即可。若囊腫較大或出現疼痛、紅腫等感染症狀，可考慮手術切除。術後要保持傷口清潔乾燥，避免沾水，防止感染。
4. 尖銳濕疣：由人乳頭瘤病毒HPV感染引起的性傳播疾病。可遵醫囑外用咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素酊、氟尿嘧啶軟膏。也可通過激光、冷凍、電灼等物理方法去除疣體。性伴侶也需同時檢查和治療，治療期間避免性生活。
5. 毛囊炎：主要因細菌感染毛囊所致，不注意生殖器衛生等易引發。可遵醫囑外用莫匹羅星軟膏、夫西地酸乳膏、復方多粘菌素B軟膏。症狀嚴重時可口服阿莫西林膠囊、頭孢呋辛酯片、羅紅霉素分散片。平時要注意個人衛生，勤換內褲。
日常要保持生殖器清潔乾爽，避免搔抓，防止痘痘破損引發感染。選擇合適的貼身衣物，減少對生殖器的刺激。規律作息，適當鍛鍊，增強身體抵抗力。治療期間嚴格按要求用藥，若症狀持續不緩解或加重，及時就醫。
