凝血功能障礙患者、泌尿系統感染未控制患者、嚴重心肺功能不全患者、輸尿管狹窄嚴重且難以擴張患者、妊娠期女性等不適合進行輸尿管腎鏡取石術。若患有結石，應及時就醫治療。
1.凝血功能障礙患者：手術會造成一定的創口，而這類患者凝血機制差，術中術後易出現難以控制的出血情況，危及生命，所以不適合。
2.泌尿系統感染未控制患者：手術操作可能會使感染擴散，加重病情，引發全身性的感染症狀，需先控制感染後再考慮手術，故暫不適合。
3.嚴重心肺功能不全患者：手術對心肺功能有一定要求，此類患者難以耐受長時間手術及麻醉過程，容易出現心肺功能衰竭等危險，不宜手術。
4.輸尿管狹窄嚴重且難以擴張患者：輸尿管鏡難以順利通過狹窄部位到達結石處進行取石操作，手術無法有效開展，因而不適合。
5.妊娠期女性：手術及麻醉用藥等可能對胎兒產生不良影響，同時孕期身體情況特殊，為保障母嬰安全，通常不適合做該手術。
患者即使不適合手術也要遵醫囑積極治療基礎疾病，比如控制感染、改善心肺功能、調節凝血功能等。要增加飲水量，每日保證充足水分攝入，促進小結石排出，緩解症狀。注意飲食均衡，根據結石成分合理調整飲食結構，比如草酸鈣結石患者減少草酸含量高的食物攝入。
