流感病毒感染一般可以全部清除。
人體自身擁有強大的免疫系統，當流感病毒入侵時，免疫系統會被激活。免疫系統中的淋巴細胞能識別流感病毒的抗原，然後啓動一系列免疫反應。B淋巴細胞會產生特異性抗體，這些抗體可以與流感病毒結合，使其失去活性，並被吞噬細胞吞噬清除。同時，T淋巴細胞能直接攻擊被病毒感染的細胞，將其裂解，釋放出病毒，再由抗體等進一步清除。
大多數身體健康、免疫力正常的人感染流感病毒後，在及時休息、補充營養等情況下，免疫系統能夠在1 - 2周左右將流感病毒全部清除，症狀也會隨之逐漸消失。而且，感染流感病毒後人體還會產生一定的免疫記憶，在一段時間內對同類型的流感病毒有一定的抵抗力。
但如果患者本身免疫力低下，比如老年人、兒童、患有慢性疾病的人群，或者感染的流感病毒毒株毒性較強，可能會導致病情較為嚴重，病毒在體內持續存在，引發併發症，影響病毒的清除。不過，通過合理使用抗病毒藥物，如奧司他韋等，也能幫助抑制病毒複製，促進病毒的清除。
感染流感病毒後要多休息，保證充足睡眠，讓身體有足夠的能量對抗病毒。飲食上要營養均衡，多攝入富含維生素和蛋白質的食物，增強免疫力。還要多喝水，促進新陳代謝，利於身體恢復。若症狀持續不緩解或加重，應及時就醫。
