一般情況下，乳桿菌活菌膠囊用後24-72小時排出。
乳桿菌活菌膠囊主要用於調節陰道內菌群平衡，治療因菌群紊亂引起的細菌性陰道病。其排出時間受多種因素影響。一方面，個體的新陳代謝速度不同會導致排出時間有差異，新陳代謝較快的人，身體對藥物的吸收和排泄相對也會快一些，可能接近24小時就會排出；另一方面，陰道的生理狀態也會影響排出時間，比如陰道分泌物的多少等，若分泌物較多，可能會促使膠囊更快排出體外，而分泌物較少時，排出時間可能會接近72小時。
用藥後的活動量也與排出時間有關。適當的活動有助於藥物在陰道內的分布和排出，活動量較大的人，藥物排出可能相對快一些；而活動量少、長時間臥床的人，排出時間可能會稍長。同時，用藥的深度和方式也會產生一定影響，放置位置較深，排出可能會稍慢。
在使用乳桿菌活菌膠囊期間，要保持外陰清潔乾燥，避免沖洗陰道，以免破壞陰道內的正常菌群。治療期間應避免性生活，防止交叉感染。如果用藥後出現局部瘙癢、紅腫等不適症狀，應及時就醫。
