一般情況下，肛門鏡檢查的過程在3 - 10分鐘。
肛門鏡檢查的時間會因多種情況而有所不同。通常，如果患者的肛門、直腸部位狀況較為良好，沒有明顯的病變、狹窄等問題，檢查過程會相對順利，可能3 - 5分鐘就能完成。醫生將肛門鏡輕柔插入肛門後，可較清晰地觀察到肛管、直腸下段的黏膜情況，快速完成檢查。但要是患者存在痔瘡、肛裂、直腸息肉等病變，或者肛門、直腸較為狹窄，醫生需要更仔細地查看病變的部位、大小、形態等，操作會更謹慎，時間可能就會延長至7 - 10分鐘。
在實際檢查中，醫生的經驗和操作熟練程度也會對檢查時間產生影響。經驗豐富、操作熟練的醫生往往能更高效地完成檢查，而經驗相對不足的醫生可能會花費稍長一些的時間來確保檢查的準確性。患者自身的配合程度也很關鍵，若患者能放鬆身體、按照醫生的指示配合檢查，檢查過程也會更順暢。
檢查後，應避免劇烈運動，保持肛門清潔，可用溫水坐浴。短時間內可能會有輕微不適，一般會自行緩解。若出現出血、劇烈疼痛等異常情況，要及時就醫。
