艾灸的順序一般為先上部後下部，先背部後腹部，先頭面後四肢，先左側後右側。
艾灸是通過點燃用艾葉製成的艾絨、艾柱，產生的艾熱刺激人體穴位或特定部位，以激發經氣的活動來調整人體紊亂的生理生化功能，從而達到防病治病目的的一種治療方法。按照上述順序進行艾灸，是基於人體經絡氣血的運行規律。上部、背部、頭面等部位相對氣血流通較為順暢，先艾灸這些部位有助於氣血的引導和疏通。而腹部、下部、四肢等部位，氣血相對容易積聚或阻滯，在前面部位艾灸的基礎上再進行艾灸，能更好地促進氣血的循環和調節。
從左右順序來說，先左側後右側也是遵循人體的生理特點。因為人體的經絡左右對稱分布，先灸左側可以使氣血在經絡中有序地流動，再灸右側能進一步平衡左右兩側的氣血。
在進行艾灸時，要保持室內空氣流通，避免艾煙過濃。同時，要注意溫度，避免燙傷皮膚。艾灸後半小時內不要用冷水洗手或洗澡，飲食上也要避免吃生冷食物。
