通常情況下，移植囊胚有可能會發生宮外孕。
囊胚移植是輔助生殖技術中的一種常見操作。在正常的受孕過程中，受精卵會在輸卵管內逐漸向子宮腔移動，並在合適的時機著床於子宮體部的內膜。而囊胚移植是將體外培養至囊胚階段的胚胎直接移植到子宮腔內。但即便如此，仍存在宮外孕的風險。因為胚胎在子宮腔內可能會游走，若其通過輸卵管開口進入輸卵管，並在輸卵管內著床，就會發生宮外孕。另外，子宮內環境的某些異常情況，比如子宮內膜炎、子宮黏膜下肌瘤等，可能影響囊胚在子宮內的正常著床，使其不得不尋找其他部位著床，從而增加宮外孕的幾率。
宮外孕對女性的身體健康危害較大。一旦發生宮外孕，隨著胚胎的生長髮育，可能會導致輸卵管破裂、腹腔內出血等嚴重後果，引起劇烈腹痛、休克等症狀，若不及時治療，甚至會危及生命。
在進行囊胚移植前，應盡可能改善子宮內環境，積極治療可能影響著床的疾病。移植後要密切關注身體變化，按照醫生的要求定期進行檢查，如通過血HCG檢測、超聲檢查等，以便早期發現異常情況。若出現腹痛、陰道流血等不適症狀，要及時就醫。
