在生吃與熟吃之間，一般生吃核桃仁更有營養。
核桃仁含有豐富的營養成分，如蛋白質、不飽和脂肪酸、維生素以及多種礦物質等。生吃時，這些營養成分能最大程度地得以保留，不會因為烹飪過程中的高溫、油炸等而受到破壞。例如，其中的不飽和脂肪酸，像亞油酸、亞麻酸等，對心血管健康有益，生吃能讓這些成分完整地進入人體，更好地發揮其調節血脂、降低膽固醇的作用。
熟吃核桃仁雖然在口感上可能會更好，但是在加工過程中，部分營養成分可能會有所流失。比如經過高溫炒制後，一些維生素可能會被破壞，降低了其營養價值。不過，熟吃也有一定的好處。對於一些腸胃功能較弱的人來說，熟吃更容易消化吸收，因為經過加熱處理後，核桃仁中的一些成分結構可能會發生變化，變得更易於腸胃消化。
但總體而言，從營養保留的角度出發，一般建議在腸胃功能允許的情況下，盡量選擇生吃核桃仁。如果擔心口感不好或者腸胃不適，可以將核桃仁稍微碾碎後食用，這樣既能保證營養，又能在一定程度上改善口感和消化情況。
