一般情況下，安全期吃了緊急避孕藥不會懷孕。
緊急避孕藥的主要原理是通過抑制排卵、阻止受精卵著床以及改變宮頸黏液的性狀等方式來達到避孕的效果。在安全期時，女性一般不會排卵，懷孕的概率本身就比較低。而緊急避孕藥進一步發揮其作用，抑制可能出現的異常排卵情況，同時讓子宮內膜的狀態不利於受精卵著床，即使有極少量精子進入體內，也難以成功受孕。
從抑制排卵方面來看，緊急避孕藥中的成分可以調節女性體內的激素水平，使卵巢暫時停止排卵功能，這樣就減少了卵子與精子結合的機會。對於那些月經週期不太規律的女性來說，安全期的判斷可能並不準確，緊急避孕藥的這一作用就能更好地防止意外排卵導致的懷孕。從阻止受精卵著床角度講，能改變子宮內膜的形態和功能，使子宮內膜變薄，不利於受精卵的著床和發育。即使在安全期有意外的受精情況發生，緊急避孕藥也能在一定程度上降低懷孕的可能性。
不過，緊急避孕藥也並非百分百有效，存在個體差異等因素可能影響其效果。而且頻繁服用緊急避孕藥可能會對女性身體造成一些不良影響，如月經紊亂等。應盡量選擇更可靠的常規避孕方法，如避孕套、口服短效避孕藥等，避免頻繁使用緊急避孕藥。
