在HPV和TCT的檢查順序上，通常先做TCT，再做HPV。
TCT檢查即液基薄層細胞檢測，是採用液基薄層細胞檢測系統檢測宮頸細胞並進行細胞學分類診斷，主要是觀察宮頸細胞的形態、結構等，看是否有異常的細胞變化，以此來初步篩查宮頸病變。這個檢查過程相對簡單，對宮頸細胞的採集主要是獲取宮頸表面及宮頸管內的脫落細胞，一般不會對宮頸造成較大的損傷或刺激。
而HPV檢查是檢測人乳頭瘤病毒的感染情況。HPV病毒有多種亞型，一些高危型的持續感染與宮頸癌的發生密切相關。在進行TCT檢查後再做HPV檢查，是因為TCT檢查時對宮頸細胞的採集等操作基本完成後，再進行HPV檢查可以減少對檢查結果的相互干擾。如果先做HPV檢查，在採集HPV樣本的過程中，可能會對宮頸細胞的分布等有一定影響，進而可能影響TCT檢查結果的準確性。
另外，先做TCT可以初步瞭解宮頸細胞的狀況，若TCT檢查結果有異常，再結合HPV檢查結果，能更準確地判斷病情，為後續的診斷和治療提供更可靠的依據。所以，一般臨床上建議先做TCT再做HPV檢查。
