通常情況下，孕早期甲狀腺功能減退不會直接導致孕酮低。
甲狀腺功能減退，簡稱甲減，是由於甲狀腺激素合成及分泌減少，或其生理效應不足所致機體代謝降低的一種疾病。在孕早期，甲狀腺激素對胎兒的神經系統發育等起著至關重要的作用。甲狀腺激素主要參與人體的新陳代謝、生長髮育等過程，它通過調節細胞的代謝活動來維持身體正常的生理功能。比如，它能促進蛋白質、脂肪、碳水化合物等營養物質的代謝，保證身體各器官和組織的正常運轉。
而孕酮是一種孕激素，它主要由卵巢的黃體分泌，在懷孕早期，孕酮對於維持妊娠有關鍵作用。它可以使子宮內膜增厚，為受精卵著床和胚胎發育提供良好的環境，還能抑制子宮平滑肌的收縮，防止流產。孕酮的分泌主要受下丘腦 - 垂體 - 卵巢軸的調節，與甲狀腺的功能並沒有直接的關聯。
不過，在某些特殊情況下，比如嚴重的甲減如果沒有得到及時有效的治療，可能會影響孕婦的整體身體狀況，進而間接影響內分泌系統的平衡。但這種影響也不是直接作用於孕酮的分泌，而是通過影響身體的整體內環境來產生一些間接的效應。
在孕期，孕婦要定期進行甲狀腺功能和孕酮水平的檢查。如果發現甲狀腺功能減退，應及時遵醫囑進行治療；若孕酮水平異常，也需進一步明確原因並採取相應措施，以保障孕期的順利進行和胎兒的健康發育。
