通常情況下，單純的扁桃體發炎咽拭子不會是陽性。
扁桃體發炎主要是由病原微生物，如細菌和病毒引起的。常見的細菌感染以乙型溶血性鏈球菌最為多見，病毒感染則可由多種病毒引發，比如鼻病毒、腺病毒等。咽拭子檢測通常是用於檢測特定病原體，比如新冠病毒等。當只是單純的扁桃體發炎，沒有感染咽拭子所檢測的特定病原體時，咽拭子結果一般為陰性。例如，一個人因為著涼後身體抵抗力下降，細菌入侵扁桃體引發炎症，這種情況下如果進行新冠病毒咽拭子檢測，由於體內不存在新冠病毒，所以檢測結果不會是陽性。
在一些特殊情況下，可能會出現陽性結果。比如在流感流行季節，患者扁桃體發炎是由流感病毒引起的，而此時進行的咽拭子檢測正好是針對流感病毒的，檢測結果就會是陽性。因為咽拭子在採集咽喉部分泌物時，能夠採集到引發扁桃體發炎的流感病毒，從而在檢測中呈現陽性反應。
在面對扁桃體發炎時，應及時就醫，明確病因。如果是細菌感染，需要使用合適的抗生素進行治療；如果是病毒感染，大多可通過自身免疫力恢復，必要時進行對症治療。同時，要注意休息，多喝水，保持口腔清潔，避免食用辛辣刺激性食物，以促進身體的恢復。
