一般來說，部分男性性病是可以根治的。
許多男性性病是由細菌、衣原體、支原體等病原體感染引起的。以淋病為例，它主要是由淋病奈瑟菌感染所致。治療時，通常會根據藥敏試驗結果選用敏感的抗生素，如頭孢曲松等。抗生素能夠特異性地作用於淋病奈瑟菌，抑制或殺滅細菌，從而消除感染源。當患者嚴格按照醫囑足量、足療程用藥後，體內的淋病奈瑟菌可被徹底清除，臨床症狀消失，達到根治的目的。再如非淋菌性尿道炎，常見病原體為衣原體和支原體，通過使用阿奇霉素、多西環素等抗生素進行規範治療，也大多可以治癒。
也有一些男性性病根治相對困難。比如尖銳濕疣，它是由人乳頭瘤病毒HPV感染引起的。HPV可潛伏在皮膚黏膜的細胞內，當機體免疫力下降時容易復發。雖然可以通過激光、冷凍、手術等方法去除疣體，但難以完全清除潛伏的病毒，所以容易復發，較難做到根治。還有艾滋病，是由人類免疫缺陷病毒HIV感染引起的。HIV會攻擊人體免疫系統，目前的抗病毒治療雖然能有效抑制病毒複製，控制病情發展，但還無法完全清除體內的病毒，患者需要長期服藥維持治療。
在發現性病相關症狀後，應及時就醫，避免自行用藥。治療期間要嚴格遵醫囑，禁止性生活，注意個人衛生，定期復查，以確保治療效果。
