通常情況下，藥流後40天能流乾淨。藥物流產是通過使用藥物來終止早期妊娠的一種方法，常用的藥物是米非司酮和米索前列醇。米非司酮可以使子宮蛻膜變性、壞死，形成壞死、剝脫而形成流產；米索前列醇可以促使子宮收縮，幫助胚胎及其附屬物排出體外。
在藥流後的一段時間內，子宮會持續收縮，促使殘留的蛻膜組織等逐漸排出。一般來說，大部分女性在藥流後的2周左右，陰道出血會逐漸停止，宮腔內的殘留物也基本排淨。到藥流後40天，身體經過一段時間的恢復和調整，子宮基本恢復至未孕狀態，宮腔內通常已無殘留組織。
不過，也有少數女性可能會出現藥流不全的情況。這可能與個體對藥物的敏感性不同、胚胎著床位置異常等因素有關。比如，有些女性的子宮收縮能力較差，就可能導致部分蛻膜組織無法及時排出，從而出現藥流後長時間陰道出血、腹痛等症狀，這種情況下40天可能就流不乾淨，需要及時就醫進行清宮等處理。
藥流後要保持外陰清潔，避免性生活和盆浴1個月，以防感染。注意休息，避免過度勞累，加強營養，促進身體恢復。如果出現陰道出血增多、腹痛加劇等異常情況，應隨時復診。
