通常情況下，膠體果膠鉍膠囊能輔助治療幽門螺桿菌感染，但一般不能單獨用於根治幽門螺桿菌。
膠體果膠鉍膠囊治療幽門螺桿菌主要是基於其在胃內的作用原理。它在酸性環境中能形成穩定的凝膠體，這層凝膠可以在胃黏膜表面形成一層保護膜，隔絕胃酸、胃蛋白酶以及幽門螺桿菌等對胃黏膜的侵蝕和損傷。同時，膠體果膠鉍還能與幽門螺桿菌產生的毒素結合，降低毒素對胃黏膜的損害，從而在一定程度上緩解幽門螺桿菌感染引起的胃部不適症狀，比如胃痛、胃脹、反酸等。而且，它還能刺激胃黏膜上皮細胞分泌黏液，進一步增強胃黏膜的屏障功能，有助於胃黏膜的修復和再生。
要想根治幽門螺桿菌，僅靠膠體果膠鉍膠囊是不夠的。目前臨床上根治幽門螺桿菌通常採用四聯療法，即一種質子泵抑制劑、一種鉍劑如膠體果膠鉍和兩種抗生素聯合使用。抗生素可以直接殺滅幽門螺桿菌，質子泵抑制劑能抑制胃酸分泌，提高胃內pH值，增強抗生素和鉍劑的作用效果。幾種藥物協同作用，才能更有效地清除幽門螺桿菌，降低復發率。
在使用膠體果膠鉍膠囊輔助治療幽門螺桿菌感染時，要嚴格按照醫囑用藥，不可自行增減劑量或停藥。用藥期間，可能會出現大便發黑等情況，這是正常現象，不必過於驚慌。同時，要注意飲食衛生，避免再次感染幽門螺桿菌。
