艾滋病核酸檢測通常在高危行為後的7-10天後進行，如果此時檢測結果為陰性，基本可以排除HIV感染。但是具體的時間則需要結合個人的檢測情況判斷。
因為艾滋病核酸檢測直接檢測的是血液中是否存在HIV病毒的遺傳物質，其窗口期較抗體檢測和抗原檢測更為短暫。通常在高危行為後的7-10天後能基本排除。雖然核酸檢測在這個時間段內可以提供早期排除信息，但其陽性結果並不能單獨作為確診HIV感染的依據，因為可能存在假陽性的情況。確診HIV感染通常還需要依賴HIV抗體檢測，因為抗體是機體對HIV感染產生的免疫反應標誌物，且其出現時間相對較晚，一般需要6周或更長時間窗口期後，抗體水平才足以被常規檢測方法檢測出來。
綜上所述，若想盡早排除HIV病毒感染，可在高危行為後約7-10天進行HIV核酸檢測，若結果為陰性，則可初步排除感染。後續仍建議在高危行為後至少4周至6周進行HIV抗體檢測，以獲得更為可靠的排除依據。若抗體檢測結果也為陰性，尤其是到8周甚至12周後仍為陰性，則幾乎可以完全排除HIV感染的可能性。
對於特殊情況，如有必要，醫生可能會建議進行更長期的隨訪檢測。
