新生兒腦水腫是否會留下後遺症，需要結合實際情況分析。如果腦水腫並不嚴重、經積極治療後實現臨床治癒，一般不會遺留後遺症。但如果治療不及時、損傷較為嚴重，可能會留下後遺症。
新生兒腦水腫指的是腦內水分增加、導致腦容積增大的病理現象，可能與宮內窘迫、產傷、顱內感染等多種因素有關。如果在確診初期配合醫生積極進行治療、控制原發病發展（如抗感染治療、清除顱內血腫、解除對腦組織的刺激和壓迫等），腦水腫可逐漸消退，一般不會留下後遺症。
但如果並未及時確診和治療、未能控制原發病發展，可能會對腦組織和中樞系統造成損傷，並造成生長髮育遲緩、智力低下等後遺症。在嚴重情況下，甚至會造成腦疝、腦死亡。因此一旦確診新生兒腦水腫，需要積極配合醫生進行綜合治療，有良好的治療依從性。
在疾病治療和恢復期，家長應加強新生兒生活護理，定期就醫復查，觀察患處具體恢復情況。
