扁桃體隱窩導致口臭可以通過口腔清理與用藥治療。
隱窩裡面的分泌物，還有食物殘渣混在一起，堵塞隱窩口，可能造成扁桃體隱窩結石。口腔清理可以使扁桃體隱窩表面盡量保持清潔，還可以用淡鹽水漱口，每天早晚各一次。或進一步使用鑷子或者吸引器對扁桃體隱窩內的分泌物進行清理，可以減少口臭氣味的來源，緩解咽喉部位的堵塞感、異物感。
患者口臭大多數是因為扁桃體隱窩發炎之後細菌存留，時間一長會滋生成厭氧菌，經常會有臭的扁桃體隱窩結石形成，可以在醫生的指導下食用胖大海含片或者草珊瑚含片，來減輕口臭的情況。扁桃體隱窩重度發炎時，建議在醫生的指導下通過抗生素消炎治療，常見的有阿莫西林膠囊、頭孢拉定膠囊等，此類藥物容易出現過敏反應，所以在服用時如果出現了皮疹或瘙癢，要注意停藥。
建議避免辛辣刺激性的食物，戒煙戒酒，飯不要吃太飽，飯後多漱口。
