咽口水上面疼但不是嗓子可能是燙傷、擦傷、口腔潰瘍等原因引起，可以通過使用藥物的方式治療。
1.燙傷：如果攝入了過燙的食物或者熱水，可能就會導致上顎被燙傷，因此在咽口水的時候就會導致局部疼痛，可以在醫生的指導下使用康復新液、重組人表皮生長因子凝膠、重組牛鹼性成纖維細胞生長因子凝膠等藥物治療。
2.擦傷：在吃堅硬食物的時候，對於過度的摩擦可能會導致上顎黏膜破損，因此也會引起局部疼痛，這種情況一般不需要特殊治療，可以通過調理飲食，保持口腔內清潔衛生，通常會逐漸的自行恢復。
3.口腔潰瘍：可能是遺傳、內分泌改變、口腔黏膜損傷等原因引起，會導致口腔內黏膜出現潰瘍面產生疼痛，在受到冷熱酸甜等刺激時疼痛會加重，可以遵醫囑使用冰硼散、口腔潰瘍散、重組牛鹼性成纖維細胞生長因子凝膠等藥物治療。
咽口水上面疼但不是嗓子除了是以上原因引起以外，還有可能是口腔皰疹等原因引起，也需要及時治療。平時需要養成良好的生活習慣，避免攝入過燙、過硬的食物，少吃辛辣刺激性的食物，比如辣椒、生薑等，並且要注意飲食衛生。
