扁桃體增生並不是必須要進行手術治療，需結合增生的情況選擇適宜的方法治療，輕症患者以保守治療為主，可咨詢醫生選擇治療藥物，而增大較大者則要給予手術方法處理。
對於因急性感染而發病的扁桃體增生患者，其症狀方面輕微，只有鼻塞鼻塞、流涕、說話時有閉塞性鼻音等表現，沒有影響到正常生活，可給予抗感染藥物治療，比如左氧氟沙星膠囊、阿奇霉素分散片等均能起到消炎、殺菌的療效。
如扁桃體增生導致患者產生氣道阻塞等表現，將會影響到正常的呼吸，這種情況是需要進行手術治療的。手術時多采用射頻輔助來切除扁桃體，再沿著扁桃體被膜進行完整切除，切除標本需要送病理檢查。但考慮扁桃體具有人體的免疫功能，而且手術切除扁桃體具有一定的危險性，因此在手術前需權衡利弊。患者在術後需定期隨訪檢查，觀察扁桃體恢復的情況。針對懷疑為扁桃體惡性腫瘤的患者，宜採用扁桃體活檢術治療，術後安排好日常飲食，減少辛辣及刺激性食物。
扁桃體增生患者在術後不宜疲勞過度，還要加強口腔內部的護理工作，飲食方面需保持營養均衡，減少刺激性嚴重的食物。
