呼吸很不舒服要深呼吸咽痛可能是急性咽喉炎、扁桃體炎、咽峽炎等疾病所致，建議使用對應的藥物治療。
1.急性咽喉炎：急性咽喉炎是細菌或者病毒感染等原因所致，會導致咽喉部位發生炎症，可能會出現呼吸很不舒服要深呼吸咽痛的症狀，建議針對感染病原體，通過抗病毒類藥物或抗生素治療，比如阿昔洛韋片、利巴韋林片等。
2.扁桃體炎：扁桃體炎可能是由於非溶血性鏈球菌、葡萄球菌等感染引起的，會導致咽部黏膜以及淋巴組織發生炎症，從而出現呼吸很不舒服要深呼吸咽痛的症狀，可配合醫生使用頭孢氨苄片、阿莫西林膠囊等抗生素治療。
3.咽峽炎：咽峽炎是發生於咽峽黏膜部位的炎症感染，可能會出現呼吸很不舒服要深呼吸咽痛的臨床表現。治療時可配合醫生服用頭孢類抗生素治療，比如頭孢氨苄膠囊、頭孢克肟片等。
在日常生活中要避免大聲喊叫，注意口腔的清潔，吃完飯以後用溫熱水漱口，少吃辣椒、生薑等刺激性的食物。
