牙齒嚴重深覆合可採用正畸、修復以及手術方法來治療。
1.正畸治療
正畸治療是應用於深覆合較為常用的治療方式，矯正時需結合前後牙以及牙槽的情況，注意壓低前牙以及牙槽的高度，從而打開咬合，積極糾正前牙軸傾斜，從而協調上下頜骨間的矢狀位置關係。患者在矯治完成之後，應當佩戴一定時間的保持器，這樣才能維持矯治的效果。
2.修復治療
如牙齒深覆合患者的年齡較大，且後牙磨耗過多，容易產生垂直高度不足的情況，在上下頜排列整齊之後，覆合依然特別的深，這種情況無法進行正畸矯正處理，可給予患者修復治療，必要時還應當墊高後牙。治療期間注意口腔內部的衛生，糾正不良的衛生習慣。
3.手術治療
針對於嚴重的牙齒深覆合患者，宜採用前牙區根尖截骨術來治療，手術時需要打開咬合，積極改正難度較大的深覆合。如患者的病情較為嚴重，應當先進行正畸治療，再矯正上下頜切牙長軸，從而排齊上下頜牙列，重新排列上頜骨以及下頜骨，這樣才能達到滿意的治療效果。
