支原體感染首選的藥物是大環內酯類藥物，如羅紅霉素、阿奇霉素、紅霉素等。如果對大環內酯類藥物過敏，可以選擇喹諾酮類或四環素類，如左氧氟沙星、多西環素等。
支原體是細胞外生存的最小微生物，感染支原體後，常用抗生素類藥物進行治療，需在醫生指導下服用相關藥物進行治療。目前醫學從人體分離的16種支原體中，發現有5種對人有致病性，如肺炎支原體、人型支原體、解脲支原體、生殖器支原體、發酵支脲解支原體，其中肺炎支原體感染會引起肺炎，其他支原體感染後，主要會引起泌尿、生殖道感染。
以上藥物雖然都屬於支原體感染的常用藥物，都具有較好的抗支原體活性作用，但是在使用時需要在醫生指導下根據個人的病情以及體質選擇合適的藥物，不可以私自盲目用藥，預防用藥不當造成不良影響。
