不存在氧氟沙星眼藥水比氯霉素眼藥水好的說法，兩者均為廣譜抗菌類滴眼液，性質相同，但作用機制卻存在一定差異性，應根據自身感染情況進行選擇。
氧氟沙星眼藥水具有一定抗菌活性，對沙雷氏菌屬、結膜炎嗜血桿菌、沙眼衣原體等微生物有很好的抑製作用。適用於結膜炎、麥粒腫、角膜潰瘍等感染性眼病的治療。
氯霉素眼藥水主要針對厭氧菌、金黃色葡萄球菌、立克次體屬等病原體進行抑制，並防止肽鏈形成，進而有效避免細菌蛋白質的合成。在臨床上常用於角膜炎、沙眼等疾病的治療。
考慮到兩種藥物在適應症方面的區別，用藥前需要先去往醫院進行相關檢查，例如體格檢查、分泌物塗片、細胞學檢查等，同時也要針對其它類似疾病進行鑒別，如單純性近視、真菌性角膜潰瘍等，明確疾病之後再由醫生給予適用藥物治療。另外要注意抗生素類滴眼液均不建議長期使用，以免產生耐藥性，或引發其它嚴重性病變產生，如視神經炎、失明等。
