部分腦軟化灶出現之後，首先應該明確其誘因，然後選擇針對性的治療手段。如果是因為腦出血或缺血所致，可使用改善腦循環、營養腦細胞的藥物進行治療。若與腦部炎症疾病有關，可使用抗炎類藥物，必要時應進行手術。
1.腦出血後缺血所造成的部分腦軟化灶，一般建議使用藥物療法，比如改善腦循環和營養腦細胞的藥物。臨床上經常應用的藥物包括鹽酸氟桂利嗪膠囊、銀杏葉滴丸、天麻素、維生素b1.維生素b6、維生素b12等等。
2.臨床上部分腦軟化灶也有可能是腦部炎症病變所致。此因素所造成的疾病，在不太嚴重的情況下，可使用抗炎藥物處理。必要的情況下，可採用手術措施，比如修復術和病灶清除術。術前應該仔細進行身體評估，以明確手術的可行性，避免帶來不良風險。
