中醫針灸治療頭痛，一般選用頭部的穴位，比如像風池穴、百會穴、頭維穴、太陽穴、目窗穴、正營穴，以及遠端的合谷穴。
如果是頸椎引起的後枕部疼痛，也可以加用後溪穴，因為後溪穴是八脈交會穴之一，通於督脈，可以起到疏通督脈經氣的作用。
如果是雙顳側疼痛的考慮是少陽頭痛，也可以加用遠端的手少陽三焦經的中渚穴、液門穴，或者也可以加用膽經的俠溪穴、足臨泣穴。
如果是頭頂疼痛的，可以加用足厥陰肝經的太衝穴，可以起到疏肝解郁的作用。
如果同時伴有面紅目赤、心情煩躁，考慮是肝火上炎所致的，可以加用行間穴，有清熱瀉火的作用。
