分泌性中耳炎也稱慢性非化膿性中耳炎，最主要病因是咽鼓管通氣功能障礙，咽鼓管是連接鼻咽部及中耳的自然通道，它的功能是維持中耳內的氣壓平衡。導致咽鼓管功能障礙，並形成分泌性中耳炎的主要原因有：
第一，最常見的原因是上呼吸道炎症，包括鼻炎，鼻竇炎，咽炎等，這時炎症會影響到咽鼓管粘膜腫脹，從而影響通氣功能；
第二，咽鼓管的物理性堵塞，比如兒童期的鼻咽部腺樣體肥大，鼻咽癌等，有時候耳悶、聽力下降等症狀是鼻咽癌的首發症狀，所以診斷分泌性中耳炎患者特別是南方地區人群，一定要詳細檢查鼻咽部以排除鼻咽癌；
第三，影響咽鼓管神經肌肉功能的疾病，比如甲狀腺功能亢進等內分泌疾病，嚴重肝腎功能異常，神經精神性疾病等。
