在進行PET掃描之前，必須取下眼鏡，首飾和其他的金屬物品，醫生會讓受檢者穿上檢查服，並使用藥物，讓病人得到放鬆；
受檢者需要喝一種造影劑，也有可能是通過靜脈注射的方法引入造影劑，這有助於掃描儀更清晰的發現體內的病變，大概等待一個小時左右，造影劑會被人體所攝取；
然後進行掃描，受檢者躺在檢查台上，滑入PET掃描儀的開口處，掃描儀的形狀像一個圓環，掃描開始時，受檢者會聽到噗呲，擦擦，翁翁的聲音；
檢查台慢慢的通過掃描儀，受檢者在檢查過程中必須保持完全靜止，整個掃描時間，大概是半個小時，在旁邊的房間，技術人員會觀察受檢者和正在拍攝的圖像，如果需要做甚麼動作，他會通過話筒，跟受檢者聯繫，檢查結束之後，受檢者就可以回家，醫生會回顧分析圖像，並作出診斷。
