腸道菌群紊亂的調理可以通過藥物調理、飲食調理及生活調理，腸道菌群紊亂是由於腸道的炎症、便秘，以及食物的刺激，所導致的腸道的菌群異位和腸道內環境的改變，而導致腸道菌群的紊亂。腸道菌群紊亂首先應該做到飲食均衡，補充益生元，另外要堅持體育鍛鍊，保持良好的心情。對於慢性消耗疾病患者使用抗生素或者激素時嚴格的掌握指徵，最好能夠做藥敏實驗，選擇敏感的抗生素：
1.藥物調理：平時可以口服抗焦慮的藥物及營養神經的藥物，若腹脹症狀比較嚴重，可適當服用一些增強胃腸動力的藥物及益生菌治療，常用的包括乳酸桿菌、雙歧桿菌三聯膠囊、藿香正氣液等；
2.飲食調理：平時應多吃含有膳食纖維比較多的食物，蔬菜、水果，比如芹菜、菠菜，以及苦瓜、蘋果、大棗。還有雜糧、粗糧，如玉米、大豆、燕麥、蕎麥等。日常要注意養成良好的生活習慣，早睡早起，避免熬夜，飲食要清淡，避免辛辣、刺激、油炸、燒烤、高脂、高糖和飲酒，盡量不要吃零食，不要隨便服用抗生素；
3.生活調理：平時要養成良好的生活作息習慣，多吃有安神作用的食物，保證睡眠的時間和質量，多參加有氧的戶外運動，減緩生活中的壓力，不要喝酒，不要吃辛辣刺激性食物，要規律飲食，勞逸結合，避免太勞累，注意腹部保暖，不要受涼，避免出現腹瀉，要保持愉快的心情。
