做磁共振一般不會產生疼痛感，只是在檢查過程中會有一些特殊的感覺。
一、噪音方面：磁共振檢查設備在運行時會產生較大的噪音，這是由於設備內部的梯度線圈快速切換電流，引起線圈振動所導致。這種噪音的音量通常較大，可能會讓人感覺不適，甚至會對聽力產生一定影響。不過，在檢查前工作人員一般會提供耳塞或耳罩等隔音設備，以幫助減少噪音干擾。
2.空間方面：檢查時需要躺在檢查床上，進入磁共振設備的檢查腔體內。部分檢查腔體相對較為狹窄，對於一些有幽閉恐懼症的人來說，可能會產生強烈的不適感，感覺空間壓抑、呼吸困難等。但現在也有一些開放式的磁共振設備，在一定程度上緩解了這種空間帶來的不適。
3.身體移動限制方面：檢查過程中要求身體保持靜止不動，因為任何微小的移動都可能影響圖像的質量，導致檢查結果不準確。這就需要在較長的檢查時間內保持一個相對固定的姿勢，可能會讓人感覺身體有些僵硬、疲勞。
在進行磁共振檢查前，要去除身上所有的金屬物品，如手錶、項鍊、耳環、假牙等，因為金屬會干擾磁場，影響圖像質量，甚至可能造成危險。如果體內有金屬植入物，如心臟起搏器、人工關節等，一定要提前告知醫生，由醫生判斷是否適合進行磁共振檢查。要按照醫生的指示保持正確的體位和呼吸配合，以確保檢查順利進行，獲得準確的檢查結果。
