細菌、真菌與病毒在形態結構、細胞結構、繁殖方式、生存方式、治療方法等方面上存在差異。
1. 形態結構：細菌有球狀、桿狀、螺旋狀等多種形態，個體微小；真菌形態多樣，有單細胞的酵母菌，也有多細胞的霉菌和大型真菌；病毒極其微小，無細胞結構，形態多樣，有球形、桿形、蝌蚪形等。
2. 細胞結構：細菌有細胞結構，無成形細胞核，只有擬核；真菌有細胞結構，有成形細胞核；病毒無細胞結構，僅由蛋白質外殼和內部遺傳物質組成。
3. 繁殖方式：細菌主要靠分裂繁殖，速度極快；真菌主要通過孢子繁殖，也可進行出芽生殖等；病毒只能寄生在活細胞內，靠自我複製繁殖。
4. 生存方式：細菌大多具有相對獨立生存能力，有自養和異養；真菌多營腐生或寄生生活；病毒只能寄生在活細胞內，離開活細胞就會變成結晶體。
5. 治療方法：細菌感染常用抗生素治療；真菌感染一般使用抗真菌藥物；病毒感染通常採用抗病毒藥物，且很多病毒感染依靠自身免疫力恢復。
日常要注意保持良好衛生習慣，如勤洗手、保持環境清潔等，降低細菌、真菌和病毒感染風險。若感染疾病，務必嚴格遵醫囑用藥治療，不可自行增減藥量或停藥，確保治療效果，促進身體康復 。
