支原體感染在臨床上主要採用抗生素治療，輔以對症治療，治療時間通常在2 - 3周左右，但具體時長因感染部位、病情嚴重程度及個體差異有所不同。
一、抗生素治療：由於支原體沒有細胞壁，作用於細胞壁的抗生素無效，臨床上常用大環內酯類抗生素，如阿奇霉素、紅霉素等，阿奇霉素一般採用口服給藥，成人劑量首日0.5g，頓服，第2 - 5日0.25g，頓服；兒童根據體重計算劑量。喹諾酮類抗生素如左氧氟沙星、莫西沙星等，對支原體也有較好療效，適用於成人，具體用量需根據病情遵醫囑。四環素類抗生素如多西環素等也可用於支原體感染治療，不過有一定副作用，使用時需謹慎評估。
2.對症治療：若患者咳嗽症狀明顯，可使用止咳藥物，如右美沙芬等緩解症狀；伴有發熱，體溫超過38.5℃時，可給予布洛芬等退熱藥物。
治療支原體感染期間，要嚴格按醫囑按時、按量服藥，不能自行增減藥量或停藥，以免影響治療效果或導致病情反復。治療過程中注意休息，保證充足睡眠，避免勞累，有助於身體恢復。飲食上，多攝入富含營養且易消化的食物，增強機體抵抗力。同時，治療後需按要求定期復查，以便及時瞭解治療效果，調整治療方案。
