肛瘻囊腫的症狀有疼痛、腫脹、流膿、瘙癢、發熱等。
1. 疼痛：肛瘻囊腫在發作初期，患者會感到肛門周圍有明顯的疼痛感，尤其是在排便時，由於糞便對囊腫的擠壓和刺激，疼痛會加劇，有時疼痛還會向會陰部、臀部等部位放射，影響患者正常的坐立和行走。
2. 腫脹：肛門周圍局部會出現腫脹現象，能明顯看到患處隆起，用手觸摸可感覺到腫塊，質地有的較軟，有的稍硬，腫脹範圍會隨著病情發展而逐漸擴大。
3. 流膿：當囊腫成熟後，會自行破潰，流出膿性分泌物，這些分泌物通常帶有異味，顏色多為黃色或黃綠色，有時還會夾雜著少量血液，而且流膿現象會反復出現。
4. 瘙癢：由於流出的膿性分泌物不斷刺激肛門周圍的皮膚，患者會感到肛門周圍瘙癢難耐，長期受刺激還可能導致肛周皮膚出現濕疹，表現為皮膚發紅、丘疹、脫屑等。
5. 發熱：如果肛瘻囊腫合併感染，炎症擴散，患者可能會出現發熱症狀，體溫可高達38℃甚至更高，同時還可能伴有乏力、寒戰等全身不適症狀。
肛瘻囊腫出現症狀後，患者要注意保持肛門清潔，排便後用溫水清洗。避免久坐、久站，防止局部血液循環不暢加重症狀。飲食上避免吃辛辣、刺激性食物，以免刺激囊腫。症狀嚴重時務必及時就醫，嚴格遵醫囑進行檢查和治療，不要自行用藥或處理，以免延誤病情。
