卡氏肺孢子蟲肺炎的治療方法主要有藥物治療、支持治療、氧療、免疫調節治療、手術治療等。
1. 藥物治療：卡氏肺孢子蟲肺炎主要由卡氏肺孢子蟲感染引發，藥物治療可有效抑制或殺滅該病原體。遵醫囑使用復方磺胺甲惡唑片，其能幹擾病原體葉酸代謝，阻礙核酸合成；遵醫囑使用噴他脒氣霧劑，可抑制病原體的DNA、RNA及蛋白質合成；遵醫囑使用氨苯碸片，能抑制二氫葉酸合成酶，從而發揮抗菌作用，控制肺部炎症，緩解症狀。
2. 支持治療：卡氏肺孢子蟲肺炎會導致患者身體虛弱、營養消耗大。通過支持治療，如補充足夠的熱量、蛋白質和維生素等營養物質，能增強患者的抵抗力，維持身體正常代謝和生理功能，有助於身體對抗疾病，促進病情恢復，提高患者對其他治療的耐受性。
3. 氧療：卡氏肺孢子蟲肺炎會嚴重影響肺部的氣體交換功能，導致患者出現低氧血症。氧療能提高患者的血氧含量，改善機體的缺氧狀態，保證重要器官的氧氣供應，減輕呼吸困難等症狀，避免因缺氧引發的一系列併發症，維持身體的正常生理功能。
4. 免疫調節治療：卡氏肺孢子蟲肺炎多發生於免疫功能低下的人群。免疫調節治療可調節患者的免疫功能，增強機體對病原體的免疫應答，幫助免疫系統更好地識別和清除卡氏肺孢子蟲，從而控制病情發展，減少疾病的復發風險。
5. 手術治療：對於少數病情嚴重、藥物治療效果不佳且出現嚴重肺部併發症，如肺大皰破裂導致氣胸等情況的卡氏肺孢子蟲肺炎患者，手術治療可切除病變組織，修復受損的肺部結構，改善肺部功能，輓救患者生命，但手術風險較高，需謹慎評估。
卡氏肺孢子蟲肺炎患者在治療期間要保證充足休息，避免勞累，居住環境保持清潔、通風良好。飲食上注重營養均衡，多攝入富含蛋白質、維生素的食物。嚴格按照醫囑按時服藥、定期復查，以便醫生及時瞭解病情變化，調整治療方案。
